Несмотря на острую критику Турции в адрес Израиля, турецко-израильские отношения в области экономики, в частности сфера торговли, переживает наилучший период в своей истории. 

На торговые отношения не повлиял даже кризис с «флотилией свободы», когда израильский спецназ силой остановил паром «Мави Мармара», направлявшийся с гуманитарным грузом из Турции пробить блокаду Газы 30 мая 2010 года. В результате действий израильских военных тогда погибло 10 турецких активистов, находившихся на судне.

К концу 2010 года Турция увеличила объем экспорта в Израиль, доведя его до 2 млрд 80 млн долларов США, то есть на 36% в сравнении с 2009 годом. Импорт увеличился на 285 млн долларов и достиг за указанный период 1 млрд 359 млн долларов США. В 2011 году внешнеторговый оборот между Турцией и Израилем составил 4 млрд 448 млн долларов, а в 2014 году –  5 млрд 832 млн долларов США. За первые четыре месяца 2018 года товарооборот увеличился на 27% по отношению к аналогичному периоду прошлого года и составил 1 млрд 332 млн долларов.

Отмечается, что соглашение между Турцией и Израилем о свободной торговли, вступившее в силу 1 мая 1997 года, актуально и по сей день. Оно обеспечивает взаимные налоговые преференции для ряда фирм и компаний двух стран.